Hay que ir a la carpeta donde uno quiere aplicar los permisos "hacia abajo"

<code bash>cd /path/to/folder</code>

ahora la magia:
<code bash>
find . -type d -exec chmod 755 {} \;
find . -type f -exec chmod 644 {} \;
</code>
755 para directorios y 644 para archivos es lo que usan la mayoría de los sitios web.